Os 80 times classificados para a competição foram divididos em oito potes (A a H) com dez clubes cada, de acordo com Ranking da CBF.
A partir daí, os cruzamentos entre os potes foram os seguintes: A x E; B x F; C x G e D x H.
Na 1ª fase, os times do grupo 1 (potes de A a D) enfrentam os do grupo 2 (potes de E a H) em jogo único; o time do grupo 1 joga fora de casa e tem a vantagem do empate.
Os subgrupos de cotas nas duas primeiras fases em 2020:
Grupo 1 (7 times) – Clubes entre os 15 primeiros colocados no Ranking da CBF (Cruzeiro 4º, Atlético-MG 7º, Bahia 10º, Chapecoense 12º, Fluminense 13º, Botafogo 14º e Vasco 15º)
Grupo 2 (5 times) – Clubes da Série A abaixo do Top 15 (Sport 16º, Ceará 19º, Goiás 20º, Coritiba 24º e Atlético-GO 25º)
Grupo 3 (68 times) – Clubes inscritos na 1ª fase que estão abaixo do Top 15 e fora da elite em 2019
A primeira fase foi disputada em partida única, de acordo com o regulamento da disputa. O mando de campo pertencerá ao clube com o pior posicionamento no Ranking Nacional de Clubes.
A Copa do Brasil começou em fevereiro e terá as finais em setembro na próxima temporada. A CBF modificou o calendário para que não ocorra conflito de datas com os momentos decisivos do Brasileirão.
Nas oitavas de final entram os times que disputaram a Libertadores e pré-Libertadores (Corinthians, Flamengo, Santos, Palmeiras, São Paulo, Grêmio, Internacional e Athletico), além do campeão da Copa Verde (Cuiabá), da Copa do Nordeste (Fortaleza) e da Série B (Bragantino).
O Athletico é o atual campeão da Copa do Brasil. Conquistou de forma inédita a taça ao bater o Internacional na final. Triunfo por 1 a 0 na Baixada e por 2 a 1 no Beira-Rio.
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